Hi

Der µC scheint ja noch zu funktionieren.
Also entweder hast du einen der Ausgangspins des Mega geschossen oder die isp-Frequenz hat sich irgendwie verstellt. Als ersten Test kannst du mal den USBisp von der Stromversorgung trennen, beide DIP-Schalter öffnen, USB-Kabel kurz anstecken, wieder trennen, DIP-Schalter schließen, Kabel wieder anstecken und testen.

Alternativ kann ich dir auch ein kleines Testprogramm schreiben das die Programmierpins mal etwas wackeln läßt so das du mit Multimeter oder LED's die Funktion prüfen kannst.

Matthias