Ich hatte es ja schon einmal geschrieben, wenn ich eine neue Datei anlege oder in den Ordnern in der IDE verschiebe ... spiegelt sich das auf der Festplatte auch nicht wieder.

In Atmel Studio kann man sich wenigstens darauf verlassen und man kann sogar Dateien die zwar im Ordner sind aber nicht im Projekt mit einem Klick anzeigen lassen.
Ich werde das Atmel Studio vermissen ... danke Microchip ... back to Eclipse