Ich habe jetzt doch noch mal mit einem Elko parallel getestet.
Das Beste Ergebnis hatte ich bis jetzt mit einem 33µF Elko.
Man kann den Lüfter noch sehr weit runter regeln und das Geräusch ist nur mehr ein leises schrilles summen wenn er weit runter geregelt ist.
Je höher man den Lüfter schraubt desto leiser wird das Piepsen und ist bei so ca. 20% nicht mehr zu vernehmen.

Ich werd jetzt eine Weile mit dem Kondensator die Schaltung laufen lassen und sehn ob was passiert. - laut Manf müsste der ja explodieren?

edit:
Ich verwende einen ULN2803 als TreiberIC.
Daran ist eine Led, der Kondensator und der Lüfter parallel angeschlossen.