ich habe zwar bisher nur mit AVR dragon und atmel ice gearbeitet aber kann auf win 10 definitv atmel studio 7 empfehlen, es gibt nichts schöneres zum debuggen, vor allem wegen der Registeroverview beim debuggen.

solltest du auf das lästige "windows update missing" problem stoßen hilft es den installer mit der option "/SystemValidationErrorAsWarning" gestartet werden (einfach aus cmd/konsole heraus starten)

atmel hat ein problem damit ein upadte zu erkennen wenn ein es nicht als einzelupdate sondern als kumulativer patch eingespielt worden ist.