Die sind schon völlig unabhängig. Bei Rest starten natürlich beide ihr Programm. EIn Reset wird auch nach der Programmübertragung durchgeführt.
Beim Programm übertragen wird glaub nur der Code überschrieben, glaube Bascom löscht vorher nicht den ganzen Flash. Das kann man aber bei Bedarf manuell machen. Braucht man aber eigentlich nicht da es meist uninteressant ist ob noch ein paar Flashbytes einen undefinierten Wert enthalten, die werden ja nicht genutzt!