Der Encoder würde dir in dem Fall nur was bringen, wenn er am Abtrieb des Getriebes sitzt und eine Auflösung von 0,03° oder besser aufweist. Ist der Encoder nur am Motor, so bekommt er nix davon mit, wenn das Getriebe wackelt. Also entweder hochauflösenden Encoder/Winkelgeber verbauen (guck mal bei AMS, die haben interessante Magnetsensoren) oder eben spielfreies Getriebe, andere Möglichkeiten sehe ich da für dich nicht. Außerdem würde ein Encoder an der Ausgangsseite die Vorteile eines Schrittmotors nutzlos machen, da wäre ein DC-Servo besser. Encoder an Schrittmotoren werden sonst meist nur zum Erkennen und Ausregeln von Schrittverlusten genutzt.
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