Hi,

Bei Programmstopp werden allerdings alle ausgehenden Signalzustände erhalten?
Sprich wenn die Peltiere gerade an waren, dann bleiben sie auch an?
Nein, im Reset die Zustände Deiner Pins hochohmig (Tri-State), das heißt dass Du die Zustände von außen definieren kannst/musst.

Wenn es nicht aufs Stromsparen ankommt, würde ich eher eine Signalleitung zum Nebencontroller rüberlegen, abfragen und entsprechend im Code drauf reagieren - oder Du nimmst gleich irgendeinen Bus (zB I2C), dann können die Controller auch miteinander reden.

Gruß
Malte