Ich benutze Avrdude (wegen Linux), PonyProg unterstützt das Programmieren per Serieller Schnittstelle (über den Bootloader) AFAIK ganicht.
Das Programmieren kann es eigentlich nicht sein, weil das ADC Beispiel klappt einwandfrei.
Den richtigen Prozessortyp? Meinst du im Bascom? Ja hab ich.

Kannst du mir vielleicht mal dein HEX file senden, dann sehn wir ja ob es am Compiler oder am Übertragen liegt.

P.S: Programmier tu ich es mit dem Befehl
Code:
avrdude -p atmega169 -P /dev/ttyS0 -c butterfly -U flash:w:M169_LCD.HEX