... ich treibe folgende zwei Motoren ... Motoren bewegen sich unterschiedlich stark ... Kommt das häufiger vor bei eigentlich baugleichen Motoren ...
Hallo, vermutlich meinst Du mit "... bewegen sich unterschiedlich stark ..." dass die sich unterschiedlich schnell drehen. Das liegt vorwiegend an Bauteiltoleranzen der Motoren, aber - vermutlich deutlich geringer - auch an den Toleranzen der Motortreiber und Deiner Installation.

... Egal in welche Richtung ich den Motor einbaue, der eine ist immer der stärkere ...
Das ist ja nun trivial, einer ist immer der Stärkere. Die Frage wäre: ist immer derselbe Motor der stärkere?

Wenn Du gleiche >>Drehzahl<< möchtest musst Du eine Regelung vorsehen, siehe hier. Auch dann drehen sich öfters beide Motoren unterschiedlich "stark" - je nach der geforderten Leistung durch Steigung, Reibung etc - aber im Rahmen der Reglergüte und -Stufe (P, PI, PlD) gleich schnell.