Hi,

laut http://www.atmel.com/images/atmel-24..._datasheet.pdf
auf Seite 2 liegt der ADC 1 auf Port C 1 also Pin 24.
evtl hast Du nur den falschen Pin erwischt.
Ich verwende START ADC, und würde es auch drin lassen. Stört ja nicht.

vielleicht wird es deutlicher ob deine Schaltung funktioniert, wenn Du anstatt die waitms durch den Wert des ADC zu erhöhen/zu verringern eher eine if-Abfrage verwendest.
pseudo-code
Code:
if analogwandler <500 then
ledgruen = 1
ledgelb = 0
ledrot = 0
else if analogwandler >500 then
ledgruen = 0
ledgeld = 1
ledrot=0
endif
.....
hier ein gutes beispiel für ADC
http://halvar.at/elektronik/kleiner_...dc_mit_getadc/

Grüße
Crypi