Die meisten Wärmeleitpasten sind elektrische Isolatoren, es gibt aber auch metallgefüllte, die zumindest einigermaßen leiten. Allerdings ist die Wärmeleitfähigkeit der Pasten auch nicht wirklich gut. Mehr als vielleicht 0,5 mm sollte man damit eher nicht überbrücken.
Wenn die Platine uneben ist, wären je Bauteil in kleiner Alu Kühlkörper zum Aufkleben (ggf. mit Wärmeleitkleber), und dann ein kräftiger Lüfter wohl eine Möglichkeit. Mit Lüfter schafften auch die kleinen Kühlkörper schon relativ viel.
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