Okay, das ist zu viel für mich.

Aber das dauert definitiv zu lange.
Baudrate in Bascom geprüft? Das könnte ich mir noch vorstellen.
Auto verify mal rausnehmen. Du beschreibst ja auch eeprom, vielleicht deswegen so langsam.

Kannst Du probehalber ein anders Program flashen welchen eine LED im sekunden takt ein und ausschaltet.
Ob das auch solange braucht und ob es auch richtig ankommt?

Hardwarefehler kann man ausschliessen?