Hm, das hört sich komisch an ...
GND ist verbunden?
ADC ist auf Single-ended eingestellt?
Die Spannung stimmt auch?
Wie hoch ist den der Prescaler des ADC? Laut DB darf der mit maximal 2Msps laufen, bei deinen 41MHz muss der Prescaler >= 32 sein. Ich würde es aber erstmal zum testen sowieso mit 512 probieren, da es dadurch genauer wird. Den MUX Kanal hast du auch richtig einstellt?

Sorry für meine doofe Fragerei, aber aufgrund meiner beschränkten C-Kenntnisse kann ich dir so besser helfen.

Gruß
Chris