Ich denke da liegst du falsch. Die 5V der USB-SChnittstelle kannst du nicht verändern.
Du kannst über USB dem µC sagen Motor1 100 und der µC setzt das um auf PWM mit dem Wert 100 von z.B. 255.
An den µC schaltest du dann Motortreiber mit der den Motoren entsprechenden Leistung.