VCC ist die Spannung vom µC (5V) und VBat ist die Versorgungsspannung 6-13,5V.

Das hat schon einen Sinn. Wenn du eine Schaltung hast die mit 5V arbeitet (TTL-ICs, andere µC,...) brauchst du 5V und nicht mehr (die max. Spannung steht im DB des jeweiligen ICs). Die Last die du da anhängst geht über den Spannungsregler.
Wenn du z.B. einen Servo oder etwas anderes das man mit mehr Spannung versorgen kann anschließt wählst du VBat. Somit hast du mehr Spannung, der Spannungsregler ist entlastet (geht nicht über den Spannungsregler).

MfG Hannes