AVRGCC, Subdir dep, was bedeutet *.o.d

[sternst]

Was bedeutet *o.d ?

Das .d steht für "dependencies", und alles davor ist das, worauf es sich bezieht.
Also z.B. main.o.d enthält die Abhängigkeiten von main.o.

PS:

praktischer Weise auch mit der kompletten aber teilweise "/../"-gekürzten Ortsangabe am Rechner.

Da ist nichts gekürzt. Im Gegenteil, durch die /../ ist die Pfadangabe sogar deutlich länger als nötig.
"a/b/c/../../d/e" ist schließlich das Gleiche wie "a/d/e".