Die Beschränkung von 32kBytes beim AVR-Dragon gab es tatsächlich in den Anfangstagen um es vom teureren JTAGICE MKII ab zu grenzen. Diese Beschränkung wurde aber in der aktuellen Firmware des Dragons aufgehoben und besteht im aktuellen AVR Studio 4.xx bzw AVR Studio 6 nicht mehr und soweit ich das sehen kann, wird der ATmega1284 vom Dragon voll unterstützt.

Bezüglich des updates der Register, während ein Programm auf dem Target läuft, kenne ich bisher von keinem JTAG Debugger. Das kann auch der JTAGICE 3 nicht. Um Register zu sehen, mußt Du das Programm anhalten oder im Einzelschittbetrieb ablaufen lassen...

Liebe Grüße,
Jürgen