Wie viel Strom braucht der Motor bei 12V maximal. Soll der Motor vor- und rückwärts laufen.
Danach richtet sich der Treiberbaustein.
Wie willst du das Boot steuern, mit einer Funkfernsteuerung?
Man kann einen DC-Motor und einen Mikrokontroller in den selben Stromkreis hängen, es sind aber geeignete Maßnahmen erforderlich damit der Motor den Kontroller nicht stört.