Ich würde dir für den Anfang den Atmgea32 oder Atmega16 empfehlen, dazu gibt es im Netz einfach am meisten Codebeispiele.
Programmieren kannst du die nur über einen speziellen USB/ISP Adapter, die muss man kaufen. Sonst würde das noch mit einer seriellen Schnittstelle und ein bisschen Hardware gehen,
aber das muss ne echte serielle Schnittstelle sein, kein USB/Seriell Wandler.
I/O Pins sind alle, wo nicht GND, AGND, VCC, AVCC RESET oder ähnliches dransteht, also PA0-7, PB0-7,PC0-7 und PD0-7.
Was meinst du mit dem gegenüberliegenden Pin? Einen anderen vom Controller?
Beim AVR musst du nicht die Stromzufuhr reglen, sondern die Spannung, 5Volt sollte man da haben, sonst ist das nicht so gut. (Weniger geht aber auch).
Dafür verwendet mann Spannungswandler ICs, die gibts sehr billig bei Conrad und reichelt.

MfG avrrobot