Die Spannungswerte für einen Microcontroller müssen exakt eingehalten werden - sonst raucht das Bauteil ab. Da alle Elektromotoren beim Betrieb insbesondere beim Beschleunigen und Abbremsen magnetisiert werden, treten Spannungsabfälle und Spannungsspitzen auf. Auch "Bürstenfeuer" kann erhebliche Spannungsschwankungen erzeugen. Mit Widerständen wirst Du da nicht weit kommen.

Ich empfehle Dir deshalb ernsthaft darüber nachzudenken, eine fertige Microcontrollerplattform (z.B. Arduino / Netduino / Gadgeteer ...) zu kaufen weil dort die Bauteile für die Spannungsregelung bereits integriert sind.

Für den Arduino ist die Spannungsversorgung wie folgt angegeben:
Input Voltage (recommended) 7-12V
Input Voltage (limits) 6-20V
... natürlich als Gleichspannung ...