Hallo,
eigentlich ist der CAN-Bus sehr störsicher, allein schon dadurch, dass der Bus symmetrisch ist (Geräte messen dann nur die Spannungsdifferenz; Störungen legen sich idR. auf beide Leitungen gleichmäßig, die fallen bei der Differenzmessung dann größtenteils raus) und mit niederohmigen Abschlusswiderständen arbeitet (niedrige Impedanz -> Störungen durch z.B. Induktion koppeln schwerer ein).
Auf die nichtbenutzten Leitungen können Spannungen über die unvermeidbare Kapazitäten zwischen den Leitungen eingekoppelt werden. Ob das etwas ausmacht, könntest du natürlich nachmessen. Dennoch würde ich jeder Leitung ein festes Potenzial zuordnen, idR. GND. (Beidseitig anschließen könnte ggf. zu unerwünschten Masseschleifen führen.)
Du könntest natürlich auch mehrere Leitungen für CANHigh und CANLow zusammenschalten.
Grüße,
Bernhard
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