Was meinst du mit "allgemeines Register"? Ich denke mal du meinst den Akkumulator. Und wenn du diesen Akkumulator mit 255 lädst und das dann ins PortD Register schreibst steht der Wert immernoch im Akumulator d.h. du musst ihn nicht mehr mit 255 laden.
Wie sind die LEDs an den Controller angeschlossen? Kann es vielleicht sein das die nur leuchten wenn der Pin 0 ist, also Active Low.