Frage zu selbstgebastelten Atmega8-Board

[toter_fisch]

der wurde durch den ISP versorgt, nicht durch 12 v.

[Kampi]

Du hast dann trotzdem eine Spannungsquelle die nicht Kurzschlussfest ist. Bei dem Spannungsregler ging es darum das der in einem Kurzschlussfall die Spannung runterregelt. Wenn du nun eine nicht Kurzschlusssichere Spannungsquelle hast spielt es für das IC keine Rolle ob es 12V oder 5V sind  
Verpolungen mögen die trotzdem nicht