Was dein AVR registriert hängt von der Programmierung ab, in deinem Fall ist es GND.
Deine Transistorschaltung würde schon funktionieren, allerdings musst du den internen PullUp im AVR aktivieren und eine 2,7V Z-Diode in den Emitter nach GND geben.
Zur Not tun es auch 4 mal 1N4148 oder ähnliches.
Wenn du Uref absenkst, den unteren Widerstand auf 3k3 verringern, dann solltest du mit zwei Dioden auskommen. Am besten ausprobieren.
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