Wenn die Signatur nicht richtig erkannt wird, heißt dass das die Verbindung über die ISP Schnittstelle nicht sicher funktioniert. Da man wohl was einigermaßen sinnvolles Auslesen kann und ggf. auch schreiben kann, ist es hier wohl so das es gerade an der Grenze ist. In diesem Fall sollte man erstmal klären woran das liegt.

Bevor man keine zuverlässige Verbindung hat, sollte man nicht auf den µC schreiben. Es kann dann nämlich auch mal versehentlich was anderes als geplant geschrieben werden. Schreiben mit einer schlechten Verbindung ist riskant. Wenn man ganz viel Pech hat, kann sogar schon beim "lesen" was passieren - da sind die Gefahren aber meist kleiner.

Die Option -F sollte man auch mit viel Vorsicht (z.B. für neuen noch nicht unterstützten µC Typ) nutzen. Da ist immer ein Risiko dabei, selbst wenn die Verbindung sonst stabil läuft.