Ja das problem scheint irgendwo bei einem Start oder Aktivierbefehl eines timers zu liegen. Er zählt schlichtweg nicht und der Interrupt wird auch nicht ausgeführt. Habe sogar jetzt extra die Hardware angeschlossen aber identisch mit der Software. Irgendwo hängts.

Wie aktiviert man einen Timer und lässt ihn loslaufen? Mit Enable capture1 ebenfalls kein unterschied.