Du holst Dir dieses Tool
http://www.chip.de/downloads/Microso..._12992066.html
und hoffst, dass es alle Einträge findet und löschst sie.
Wenn das nicht hilft, holst Du Dir dieses Tool
http://www.chip.de/downloads/Regmon-7.04_12993647.html
startest es, stellst die Filter entsprechend ein und startest das Setup von AVRStudio. Nach Erscheinen des AVR-Meldung stopst Du das Regmon und siehst nach, auf welche Registryeinträge es zugegriffen hat. Die löschst Du dann per Hand, allerdings erst, NACHDEM du die entsprechenden Eintrage gesichert hast!!!
Falls dabei was schief läuft, kannst Du die Einträge durch Doppelklick auf die erstellte reg.Datei wiederherstellen.
Gruß