JTAG ist aus, am PortC ist die Motorsteuerung dran.
AVCC ist an VCC, braucht man ja auch am m32.

SFIOR habe ich nicht verwendet, ich setze die Pins so:
/* Eingänge mit Pullup*/
DDRA &= ~(1 << PA4); PORTA |= (1<<PA4); //Bumper
DDRA &= ~(1 << PA6); PORTA |= (1<<PA6); //Taster rot
DDRA &= ~(1 << PA7); PORTA |= (1<<PA7); //Taster schwarz

DIDR0 ist nicht gesetzt, laut Dok senkt es nur den Stromverbrauch, und der ist da mehr als vernachlässigbar. Aber ich werde es mal damit probieren.

Die anderen Unterschiede bei den Timern, PWM, USART habe ich alle geschafft, und nun schaffen mich simple IO Pins

LG!