Ja ok blöde Frage...der Bootloader zieht die 2 LEDs auf 5V deshalb leuchten sie. Auf deinem is der ja nicht
Was ich mir jetzt noch vorstellen kann ist das entweder die Fuses falsch eingestellt sind. (CKSEL0..3 müsste auf 1111 sein laut Datenblatt) Oder vll auch die LEDs kaputt sind.
Wobei wenn du mit dem Oszi ein Rechtecksignal misst, dann dürfte nur die Frequenz nicht stimmen und du nimmst das Blinken nicht wahr. Also Fuses prüfen^^