Was für nen Programmer hast du denn? Entweder direkt über das AvrStudio, oder über PonyProg. Afaik geht das auch irgendwie mit Bascom, das ist aber umständlich. Wenn du es ein bisschen mehr Hardcore magst, dann schau dir mal avrdude an.

WinAVR ist dein Compiler, der dir das Programm übersetzt. Wird vom AVR-Studio benötigt.