Punkt 1: Der PCINT wird ja durch einen erkannten Pegelwechsel getriggert, damit ließt du ja automatisch den Wert ein, der den PCTINT ausgelöst hat - außer der Pegel hat inzwischen noch einmal gewechselt ...

Punkt 2: Der PCINT wird ja auch bei der fallenden Flanke aufgerufen - irgendwie musst du ja erkennen, wann der Zählwert übernommen werden soll.

Geh mal ein Stück von der Leitung runter, dann wirds evtl. klarer :P

mfG
Markus