Ich kenne EMC nicht so genau, aber wenn ich mich recht erinnere, erzeugt die Software alle impulse auf dem Parallelport? Also um ein wenig programmieren kommst Du nicht drumherum.

Skeinforge erzeugt GCode mit ein paar besonderen "M"-Codes, die Du dann abfangen musst und in ein entsprechendes Signal umwandeln musst, entweder direkt am Parallelport, wen Du noch so viele Pins frei hast, oder über die RS232 an den Extrudercontroller.

Der Original Extrudercontroller verwendet übrigens einen RS485 Bus. Vielleicht ist es einfacher, einen RS232->485 Umsetzer mit dem Originalboard zu nutzen? Ist aber auch Bastelei!