Weiters sehe ich keinen Entstörkondensator an den Versorgungsspannungsanschlüssen des Mega8, ich würde hier unbedingt noch zwei 100nF-Keramik-Kondensatoren einplanen. Ebenfalls über einen 100nF-Kerko würde ich AREF auf Masse legen, damit die Referenzspannung schön sauber ist.
Nochmal dazu, also insgesammt 3 Stück?
1. auf den AREF(Pin21).
2. zwischen 5V und GND
3. zwischen 12V und GND

Entweder du verwendest einen PNP-Transistor, oder du setzt den NPN-Transistor unter die LEDs.
für einen NPN bräucht ich doch negatives Potential, oder iree ich mich jetzt dabei?

Für den PNP unter den LEDs hätte ich doch eine Kurzschluss beim durchschalten, da die Basis dann auf Masse liegt. (jedenfalls hatten ander das oft genug damals in der schule) Zudem würden die LEDs doch auf gewisse weise dauernt unter Spannung stehen.