Die Transmit und Receive Funktion kannst du abschalten.
Z.B. beim Mega8 im Register UCSRB die Bits TXEN und RXEN auf 0 setzen.
Dann kannst du die Pins per DDRx Register anders nutzen.
Allerdings weiß ich nicht, ob du die Funktion auch einfach wieder einschalten kannst, indem du TXEN und RXEN wieder auf 1 setzt.
Musst du mal ausprobieren.

Gruß

Rolf