Einen externen Takt erzeugt man am einfachsten an einem der OC... Pins. Die Höchste Frequenz sollte wohl die halbe Taktfrequenz sein. Entweder den Timer im CTC mode bis eins zählen lassen und dann den Ausgang invertieren, oder ein PWM Signal 2 Takte lang mit Pulslänge ein takt. Den vollen Takt kann man bei einigen der neueren AVRs auch direkt ungeteilt auf einen speziellen Pin ausgeben, dann aber nicht so einfach abstellen.

Bei der PWM Periode kann ein Interrupt ausgelöst werden. In jedem Fall geht der output compare Interrupt. Bei einigen Modes könnte auch der Overflow Interrupt gehen.