Ein normaler NPN transistor als Verpolungsschutz ist noch gerade so sinnvoll (wegen dem Stromverbrauch). Ein Darlingtontransistor ist aber eine ganz schlechte Wahl, denn man hat wenigstens rund 0,6 V Spannungsabfall, das ist mehr als bei einer Shottkydiode. Dazu kommt noch das etwas fragliche Verhalten bei "falscher" Polung.

Bei 5 V ist auch nicht sicher das man die etwa 0,3-0,5 V an Spannungsabfall an einer Schottkydioe akzeptieren kann. Da bietet sich wirklich die Schaltung mit Sicherung und Diode oder halt mit dem dem MOSFET an, notfalls halt eine Logic level Version.
Wenn schon Shottkydiode, dann sollte die reichlich dimensioniert sein, damit der Spannungsabfall nicht allzugroß wird. Für 3 A Strom also lieber eine 5-10 A Version.