genau. einfach nur die Diode umdrehen, hier wirkt sie als Verpolungsschutz... Falls du größere induktive oder kapazitive Lasten an den 7805 (oder vergleichbare Längsregler) betreibst empfiehlt es sich, eine Freilaufdiode einzusetzen (In Durchlaßrichtung vom Out zum In), um den Regler zu schützen, sollte hier aber nicht nötig sein.

noch ein paar Punkte:
Bei AREF fehlt noch der 100nF Kondensator nach GND.
Bei AVCC könntest du noch eine Induktivität (~10mH, ist aber relativ egal) zwischen VCC(5V) schalten.
Ein 10µF Elko von VCC(5V) nach GND kann auch nicht schaden.
Wieso 2x Kondensatoren am 7805-IN?
Eine einfache Led, die anzeigt ob das Board an der Spannung hängt, kann auch hilfreich sein.
Die RS232-Signale würde ich auch noch auf eine Stiftleiste herausführen (einfach: RX, TX, GND; umfangreicher: RX, TX, RESET, VCC, GND [zum flashen via Bootloader]).
Würde auch den 10-pol. ISP-Stecker empfehlen, haben einfach die meisten Programmer.

mfg