Die AGND/ AVCC pins fehlen noch. AGND muß an einer geeigenten Stelle mit GND verbunden werden. Die Leiste mit den AD Eingängen sollte dann auch besser an AGND. An AREF sollte jeweils ein Kondensator nach AGND.

Die Resetleitung sollte mit einen 10 K Pullup auskommen, dafür viellicht noch ein 1 nF Kondensator nach GND. Bei den Rsetleitungen wäre zu überlegen hier Jumper vorzusehn, um einen der Chips lahmzulegen ohne ihn aus der Fassung hebeln zu müssen.

Die MOSI oder MISO (weiss gerade nicht welche) Leitung sollte zum Stecker besser einen Widerstand von etwa 1-2 K bekommen, denn beim Programmieren ist der Pin Ausgang und könnte von einer externen Schaltung gestört werden.

Die RX/TX Pins werden wohl auch noch Jumper zum USB gebrauchen können.

Den Quarz am Mega32 könnte man besser senkrecht unterbringen.
Die Diode am Eingang sollte man besser einfach in Reihe zur Versorgung schalten, nicht als kurzschluß bei falscher Polung. Wenn die Spannung so knapp ist, dass die 0,7 Verlust stören, dann wäre ein lowdrop-Regler angebraucht.