Hallo Zusammen,

das hört sich vielleicht etwas wüst an, aber versuch doch mal die LED, wenn es denn wirklich zwei antiparallel geschaltete sind, mit Vorwiderstand zwischen zwei I/O-Pins zu hängen. Der eine Pin gibt das normale PWM-Signal aus, der andere das invertierte.
die Farbmischung sollte damit klappen, aber ob die Helligkeit trotz Vorwiderstand konstant bleibt weiß ich nicht.
Eventuell mußt Du auch die I/O-Ports mit Dioden vor "Eingangssignalen" schützen, derweil Sie als Ausgang funktionieren sollen.
Viel Erfolg
Patrick