Eine Photodiode liefert reltiv wenig Strom. Ohne extra Verstärkung wird das relativ langsam, geht aber gerade noch. Am einfachsten so verschalten: Photodiode mit der Kathode (Ring) an den Eingang, mit der Anode an GND. Dazu noch ein Pullup Widerstand passender größe. Mit etwas Glück geht da der interne Pullup im avr.

Mit einem Laserpointer kann man immerhin mit fast 0,1 mW rechen, was gut 0,05 mA entsprechen würde. Für 5 V Spannungs hub sollte der Widerstand dazu 5 V / 0.05 mA = 100 KOhm sein. Wenn es Empfindlicher sein soll, dann halt etwas mehr. Die "Verstärkerschaltung" ist falsch: wenn schon dann + und - Ausgang vertauschen und R2 müßte gerade den Pullup von oben ersetzen, also eher größer. AUßerdem die Photodiode andersherum. Dann sollte man auch einen OP nehmen, der mit Spannunge um GND arbeiten kann (z.B. TLC272, LM35 Bild   und keine Komperator.