Dann stimmt etwas mit deiner avr-gcc-Installation nicht.
Du hast nicht zufällig selber an der Ordnerstruktur was geändert?
Such mal nach io.h und io8535.h. Wie lauten deren Pfade relativ zum Installationsordner von avr-gcc?

Ach, noch was:
In deinem ersten Post steht ATmega8535, wieso dann mcu=at90s8535?