Für IR Licht sind die Schwarzen Sifte nicht alle schwarz!. Oft sind sie relativ durchlässig.

Die Pegel können sich schon etwas unterscheiden. Zum anpassen würde es aber reichen den Widerstand anzupassen. Die Widerstandsmessungen am Phototransistor sind wenig aussagekräfitig wei ein Phototransistor ein Stromsignal ausgibt. Zum testen könnte man z.B. den AD wandler im Mega8 nehmen.