Ups,
die Configuration Options gibt es anscheinend nur bei C-Code.

Ich hab jetzt mal das Tutorial durch gemacht. Bei mir hat es funktioniert.
Ich hab aber auch eine andere Version vom Studio:

AVR Studio 4.13.571 Service Pack 2
GUI Version 4, 13, 0, 569
AVR Simulator 1, 0, 2, 0
AT90S2313 195

Operating System
Major 6
Minor 0
PlatformID 2
Build 6000

Plugins:

AvrPluginAvrAsmObject 1, 0, 0, 46
AvrPluginavrgccplugin 1, 0, 0, 9
Stk500Dll 1, 0, 1, 10

Hast Du schon mal versucht, alles wieder zu deinstallieren und danach nochmal neu zu installieren? Vielleicht bringt das ja was.
Ansonsten könntest Du es nochmal auf einem anderen Rechner versuchen, falls Du die Möglichkeit hast.

Sorry, dass ich dir nicht weiter helfen konnte,

Drew