Die in den Fets interne Diode wirkt nur in einer Brückenschaltung als Freilaufdiode, in der einfachen PWM Schaltung mit einen FET ist die Dioden praktisch ungenutzt.
Was mach den 470uF Elko parallel zur Freilaufdiode ? Bei so einem Elko parallel hat man kein richtiges PWM Signal mehr und schon so viele Verluste im FET, da macht die langsame Diode dann auch nichts mehr.

Je nach dem wie man die Ansteuerung der Brücke macht, kriegen 2 der Dioden nur kurze Spitzen ab. Da könnte man eventuell Dioden für weniger Strom nehmen. Bei z.B. 50% PWM fließt der Motortrom die Hälfe der Zeit über eine der Dioden und einen transistor. Bei Mosfets als Schaltern ist es damit durchaus möglich das die Dioden mehr Wärme abgeben als der FETs.