Also, wo du die Massen der beiden Netzteile verbindest ist grob gesagt egal.

Es reicht wenn die irgendwo leitend verbunden sind, und du von einem Masseanschluss eines Netzteils dann zur Karte gehst.
+5V und +12V müssen natürlich direkt an der Karte angeschlossen werden.

Erklärung:
Die 5V sind keine Absolute Angabe. Spannung ist eigentlich eine Differenz in der Aufladung zweier Punkte. (Potenziale)

Die Pluspole der beiden Netzteile haben gegen die Minuspole 5 bzw. 12V Unterschied.

Aber der Pluspol vom einen Netzteil hat zum Minuspol eines anderen Netzteil vielleicht auch 10V. Lässt sich nicht vorhersagen.

Wenn du nun beide Minuspole verbindest, liegen beide auf dem selben Bezugspotenzial, und an den Pluspolen liegen wirklich 5 und 12 Volt an.

Ich hoffe dass das einigermaßen verständlich formuliert war.