Viele ISP Programmierer kommen mit 3.3 V nicht so richtig klar. Ich glaube nicht, das das Programm etwas mit dem Ausfall zu tun hat. Eher ist das ein Problem mit der Versortgungsspannung oder dem Programmierer. Auch auf einem Steckbrett sollte man die Entkoppelungs kondensatoren anschließen und natürchlich GND,AGND, VCC und AVCC anschließen. Einige Mega 8 sollen zwar auch ohne AVCC gehen, aber da sollte man sich nicht drauf verlassen.