Den Rechner selber wird man so schnell nicht zerstören, höchstens die Soundkarte, und da auch wohl nur den Eingang.
Wenn man sicher geneg will man sich eine relativ einfache Schutzschaltung dazu bauen. Im einfachsten fall sind das für jeden Kanal 2 Widerstände und 4 Dioden. Eventuell kann man auch noch gleich einen zuschaltbaren Spannungsteiler (ca. 1:50) dazutun um auch etwas höhere Spannungen messen zu können.