Die dicken Elkos können nur die Rippel verkleinern, den Einbruch nicht. Um das Problem mit dem ADWandler zu umgehen, schließt man wenn es Sinn macht normalerweise Vcc als Referenz an. Wenn dann die Spannung einbricht, dann tut sie das für Aref UND für das zu messende Signal. Vorraussetzung ist, dass das zu messende SIgnal in gleicher Weise beeinflusst wird, zb weil es von einem U-Teiler stammt, der ebenfalls an Vcc hängt. Dann jedenfalls stimmt das Verhältnis wieder. In diesem Fall musst Du versuchen die Rippel wegzubekommen.
Gruß