Bei der PWM bleibt die Frequenz gleich, es ändert sich nur das Tastverhältnis.
Du musst einen Timer den Prescaler einstellen das du bei Überlauf die tiefste Frequenz erreichst die du willst. Compare Match und CTC einstellen. Die Werte im CompareMatch Register ergeben dann die Tonhöhe. In der ISR dann ein Port toggeln.