Tja, irgendwo muss man bei dem kleineren Prozessor ja sparen. Der Mega16 hat nun mal nur 2 Vergleichsregister für den Timer 1, von daher funktioniert Deine Methode so nicht mehr.

Einfachste Lösung:
An OC1B einen discret aufgebauten Inverter hängen (ein FET + 1 Widerstand), und schon hast Du auch ein invertiertes PWM-Signal.
Es muss ja nicht immer alles der Prozessor machen...

askazo